Akademija poljoprivrednih znanosti (APZ) utemeljena je na Osnivačkoj skupštini održanoj 08. lipnja 2017. godine u Zagrebu.
Osnivačka je skupština sazvana na poziv Inicijativnog odbora u sastavu: akademik Franjo Tomić, professor emeritus, dr. sc. Gordana Kralik, professor emerita, akademik Ferdo Bašić, professor emeritus, prof. dr. sc. Zoran Grgić, prof. dr. sc. Vlado Guberac i prof. dr. sc. Boro Mioč.
Osnivačkoj je skupštini prisustvovalo 128 članova-osnivača Akademije koji su na prijedlog Inicijativnog odbora jednoglasno usvojili Statut, izabrali predsjednika (akademik Franjo Tomić, professor emeritus), dopredsjednike (prof. dr. sc. Vlado Guberac; predsjednik Odjela za bilinogojstvo, dr. sc. Gordana Kralik, professor emerita; predsjednica Odjela za stočarstvo i ribarstvo, prof. dr. sc. Tajana Krička; predsjednica Odjela za interdisciplinarne znanosti, akademik Ferdo Bašić, professor emeritus; Znanstveno-istraživačka i stručna djelatnost), glavnog tajnika (prof. dr. sc. Zlatko Šatović), te ostale članove predsjedištva (izv. prof. dr. sc. Zvonimir Zdunić, znanstveni savjetnik; tajnik Odjela za bilinogojstvo, prof. dr. sc. Boro Mioč, tajnik Odjela za stočarstvo i ribarstvo, prof. dr. sc. Zoran Grgić, tajnik Odjela za interdisciplinarne znanosti, prof. dr. sc. Matija Domaćinović, prof. dr. sc. Jasminka Igrc-Barčić, prof. dr. sc. Darko Kiš, prof. dr. sc. Edi Maletić, dr. sc. Slavko Perica, prof. dr. sc. Davor Romić, prof. dr. sc. Tomislav Treer, prof. dr. sc. Sonja Vila, prof. dr. sc. Krunoslav Zmaić) kao i članove Nadzornog odbora (prof. dr. sc. Nikola Mirošević, dr. sc. Smiljana Goreta Ban, prof. dr. sc. Nikola Stipić).
Istodobno je donijeta jednoglasna odluka o davanju ovlaštenja za zastupanje predsjedniku (akademik Franjo Tomić, professor emeritus), te glavnom tajniku (prof. dr. sc. Zlatko Šatović) Akademije ne bi li zatražili i ishodili rješenja odnosno potvrde kako bi novonastala Akademija ispunila sve zakonske propise nužne za njezin uspješan rad što je to bilo i učinjeno kako slijedi:
(a) RH, Ministarstvo znanosti obrazovanja i sporta izdalo je 21. rujna 2017. Odobrenje korištenja naziva 'Akademija'.
(b) RH, Grad Zagreb, Gradski ured za opću upravu izdao je 26. rujna 2017. Rješenje o upisu udruge u Registar udruga RH pod registarskim brojem 21012687.
(c) RH, Ministarstvo financija, Porezna uprava izdalo je 02. listopada 2017. Potvrdu o Osobnom identifikacijskom broju Akademije poljoprivrednih znanosti, OIB: 78732556191.
(d) RH, Državni zavod za statistiku izdao je 16. listopada 2017. Obavijest o razvrstavanju poslovnog subjekta prema NKD-u 2007., te dodijelila Akademiji poljoprivrednih znanosti Matični broj poslovnog subjekta: 4795857.
(e) Akademija poljoprivrednih znanosti otvorila je 23. listopada 2017. transakcijski račun kod Zagrebačke banke d.d., Zagreb pod brojem IBAN: HR6623600001102641832.
Prvi (konstituirajući) sastanak Predsjedništva i Nadzornog odbora Akademije poljoprivrednih znanosti (APZ) održan je 13. studenog 2017. godine u Zagrebu. Na sastanku je, temeljem Statuta, naloženo dopredsjednicima Akademije (prof. dr. sc. Vlado Guberac; Odjel za bilinogojstvo; dr. sc. Gordana Kralik; professor emerita, Odjel za stočarstvo i ribarstvo; prof. dr. sc. Tajana Krička; Odjel za interdisciplinarne znanosti) da održe osnivačke sjednice Odjela Akademije, te predlože plan rada.
Osnivačka sjednica Odjela za interdisciplinarne znanosti održana je 05. srpnja 2018. godine na kojoj je prof. dr. sc. Tajana Krička potvrđena kao predsjednica, prof. dr. sc. Zoran Grgić kao tajnik, te izv. prof. dr. sc. Ružica Lončarić kao zamjenica tajnika Odjela.
Osnivačka sjednica Odjela za bilinogojstvo održana je 22. studenog 2018. godine na kojoj je prof. dr. sc. Vlado Guberac potvrđen kao predsjednik, izv. prof. dr. sc. Zvonimir Zdunić kao tajnik, te dr. sc. Siniša Srećec kao zamjenik tajnika Odjela.
Osnivačka sjednica Odjela za stočarstvo i ribarstvo održana je 22. studenog 2018. godine na kojoj je dr. sc. Gordana Kralik, professor emerita potvrđena kao predsjednica, prof. dr. sc. Boro Mioč kao tajnik, a prof. dr. sc. Zvonko Antunović kao zamjenik tajnika Odjela.